Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP4AP20648 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP4AP20648 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms