Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZKSCAN1P17029 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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