Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB4P16144 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB4P16144 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms