Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFAP15692 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms