Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A1P13866 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms