Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARGP13631 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARGP13631 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARGP13631 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARGP13631 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARGP13631 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARGP13631 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARGP13631 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RARGP13631 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARGP13631 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms