Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL6A2P12110 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL6A2P12110 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms