Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMC1P11047 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMC1P11047 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms