Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD28P10747 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD28P10747 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD28P10747 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms