Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRFP10586 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms