Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VIL1P09327 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VIL1P09327 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VIL1P09327 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VIL1P09327 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIL1P09327 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIL1P09327 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VIL1P09327 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIL1P09327 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VIL1P09327 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VIL1P09327 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VIL1P09327 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VIL1P09327 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
VIL1P09327 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIL1P09327 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIL1P09327 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIL1P09327 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIL1P09327 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIL1P09327 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VIL1P09327 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VIL1P09327 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms