Protein–RNA interactions for Protein: P08425

MSF1, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSF1P08425 TEX1YNL253W 1269 nt2.85□□□□□ -1.95
MSF1P08425 YBL096CYBL096C 309 nt2.85□□□□□ -1.95
MSF1P08425 RPS10AYOR293W 318 nt2.85□□□□□ -1.95
MSF1P08425 GPI2YPL076W 843 nt2.85□□□□□ -1.95
MSF1P08425 DIA2YOR080W 2199 nt2.85□□□□□ -1.95
MSF1P08425 MDM1YML104C 3384 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 ILS1YBL076C 3219 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 CSR2YPR030W 3366 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 YDL050CYDL050C 372 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 YFL051CYFL051C 483 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 ERP6YGL002W 651 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 SCM4YGR049W 564 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 YGR114CYGR114C 390 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 REC102YLR329W 795 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 YNL013CYNL013C 378 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 TRM112YNR046W 408 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 MUM2YBR057C 1101 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 HFM1YGL251C 3564 nt2.84□□□□□ -1.95
MSF1P08425 VPS64YDR200C 1815 nt2.84□□□□□ -1.96
MSF1P08425 PMR1YGL167C 2853 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YSP2YDR326C 4317 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 AI2Q0055 2565 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 TSC13YDL015C 933 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 DDI2YFL061W 678 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 ADH4YGL256W 1149 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 SOL3YHR163W 750 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YIL054WYIL054W 318 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YAR069CYAR069C 294 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 SAM37YMR060C 984 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 DDI3YNL335W 678 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YPL276WYPL276W 438 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YSA1YBR111C 696 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YBR300CYBR300C 498 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 RCY1YJL204C 2523 nt2.83□□□□□ -1.96
MSF1P08425 PRP8YHR165C 7242 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 PSK1YAL017W 4071 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 AST2YER101C 1293 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YJR020WYJR020W 333 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 DID4YKL002W 699 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 RPL20BYOR312C 519 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 snR34snR34 203 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 MPS1YDL028C 2295 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 RSN1YMR266W 2862 nt2.82□□□□□ -1.96
MSF1P08425 RIF1YBR275C 5751 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 RAX2YLR084C 3663 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YIL169CYIL169C 2988 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 PCL7YIL050W 858 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 SDH3YKL141W 597 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 SSU72YNL222W 621 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YPL071CYPL071C 471 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YPL107WYPL107W 747 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 SPH1YLR313C 1593 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 CLN2YPL256C 1638 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 FRE2YKL220C 2136 nt2.81□□□□□ -1.96
MSF1P08425 RPN4YDL020C 1596 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 ERG11YHR007C 1593 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 COM2YER130C 1332 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 RRG1YDR065W 1098 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 ARI1YGL157W 1044 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YGR073CYGR073C 372 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 ATG27YJL178C 816 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YLR076CYLR076C 423 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 AAR2YBL074C 1068 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YBL108WYBL108W 306 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YPR027CYPR027C 834 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 ITC1YGL133W 3795 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 IRC3YDR332W 2070 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 WHI3YNL197C 1986 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 BEM4YPL161C 1902 nt2.8□□□□□ -1.96
MSF1P08425 HBT1YDL223C 3141 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 CCT7YJL111W 1653 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 PSP1YDR505C 2526 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YDL186WYDL186W 834 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 DYN2YDR424C 279 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 ISC10YER180C 804 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YLR230WYLR230W 306 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 NDL1YLR254C 570 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YLR400WYLR400W 474 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YML037CYML037C 1023 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 RPL20AYMR242C 519 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 YOR385WYOR385W 873 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 FIG1YBR040W 897 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 PRM4YPL156C 855 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 POL30YBR088C 777 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 MUS81YDR386W 1899 nt2.79□□□□□ -1.96
MSF1P08425 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.78□□□□□ -1.96
MSF1P08425 EAP1YKL204W 1899 nt2.78□□□□□ -1.96
MSF1P08425 UBP14YBR058C 2346 nt2.78□□□□□ -1.96
MSF1P08425 APC11YDL008W 498 nt2.78□□□□□ -1.96
MSF1P08425 SMX2YFL017W-A 234 nt2.78□□□□□ -1.96
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