Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSN3P07498 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSN3P07498 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSN3P07498 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSN3P07498 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSN3P07498 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSN3P07498 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSN3P07498 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms