Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TYMSP04818 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYMSP04818 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYMSP04818 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYMSP04818 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TYMSP04818 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TYMSP04818 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TYMSP04818 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TYMSP04818 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TYMSP04818 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TYMSP04818 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms