Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYNGR4O95473 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms