Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLOT1O75955 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms