Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH16O75309 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH16O75309 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH16O75309 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH16O75309 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH16O75309 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH16O75309 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH16O75309 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH16O75309 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH16O75309 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH16O75309 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH16O75309 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH16O75309 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH16O75309 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH16O75309 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH16O75309 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH16O75309 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH16O75309 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH16O75309 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH16O75309 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH16O75309 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH16O75309 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH16O75309 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH16O75309 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH16O75309 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH16O75309 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH16O75309 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms