Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX6O43752 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX6O43752 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX6O43752 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX6O43752 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX6O43752 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX6O43752 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX6O43752 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms