Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYTH3O43739 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH3O43739 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms