Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC11O43248 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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