Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms