Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FANCAO15360 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FANCAO15360 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
FANCAO15360 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCAO15360 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCAO15360 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FANCAO15360 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
FANCAO15360 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCAO15360 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCAO15360 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCAO15360 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCAO15360 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCAO15360 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCAO15360 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCAO15360 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FANCAO15360 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
FANCAO15360 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FANCAO15360 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
FANCAO15360 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
FANCAO15360 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FANCAO15360 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCAO15360 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCAO15360 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCAO15360 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCAO15360 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCAO15360 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCAO15360 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCAO15360 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCAO15360 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCAO15360 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms