Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP290O15078 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP290O15078 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP290O15078 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP290O15078 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP290O15078 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP290O15078 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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