Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCANO14594 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCANO14594 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCANO14594 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCANO14594 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCANO14594 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCANO14594 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCANO14594 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCANO14594 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms