Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE40O14503 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE40O14503 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms