Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms