Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H7C1W4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H7C1W4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H7C1W4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H7C1W4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H7C1W4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H7C1W4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
H7C1W4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H7C1W4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H7C1W4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H7C1W4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H7C1W4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms