Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-2B6SEH9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms