Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms