Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD3A6NKT7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms