Protein–RNA interactions for Protein: A6NGD5

ZSCAN5C, Putative zinc finger and SCAN domain-containing protein 5C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN5CA6NGD5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZSCAN5CA6NGD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZSCAN5CA6NGD5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms