Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1LA6NFU8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGPEP1LA6NFU8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms