Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF804BA4D1E1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF804BA4D1E1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms