Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms