Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD2APQ9Y5K6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CD2APQ9Y5K6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CD2APQ9Y5K6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms