Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSX2IPQ9Y2D8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms