Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM50BQ9Y247 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM50BQ9Y247 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM50BQ9Y247 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM50BQ9Y247 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM50BQ9Y247 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms