Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PHF8Q9UPP1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms