Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAF8Q9UPN6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAF8Q9UPN6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms