Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX7Q9UNH6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX7Q9UNH6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms