Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNRGQ9UMZ2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNRGQ9UMZ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNRGQ9UMZ2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNRGQ9UMZ2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms