Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF608Q9ULD9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ZNF608Q9ULD9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZNF608Q9ULD9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms