Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3BQ9UH17 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms