Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLKQ9UBT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLKQ9UBT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms