Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SAE1Q9UBE0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms