Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMG20BQ9P0W2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms