Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKD2L1Q9P0L9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKD2L1Q9P0L9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms