Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EHD3Q9NZN3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHD3Q9NZN3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms