Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM260Q9NX78 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM260Q9NX78 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms