Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM161AQ9NX61 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM161AQ9NX61 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms